1、贯彻执行出入境卫生检疫、动植物检疫和进出口商品检验的法律、法规和政策规定、工作规程和上级检验检疫局的工作方针，负责三亚辖区内的出入境检验检疫、鉴定和监管等行政执法工作。
2、负责三亚辖区内的出入境集装箱、动植物性包装物、铺垫材料（用作植物、植物产品的包装物除外）的检疫和监管工作。
3、负责对三亚辖区内出入境货物（商品）的现场查验和监管工作；负责对装运出口易腐烂变质的食品、冷冻品的集装箱实施适载检验。
4、负责三亚辖区内的卫生监督、传染病监测和动植物疫情监测，收集、分析、整理、提供有关信息。
5、负责对辖区内实行出口质量许可、卫生检疫注册登记的生产企业监督检查。
6、承担辖区内出入境货物（商品）及集装箱的受理报检、计费、收费、按规定分流转送证单、验证、发证、放行、业务统计等工作。
7、承办海南出入境检验检疫局交办的其他工作。　

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